Lệ phí thủ tục hải quan là khoản chi phí bắt buộc nhưng thường bị doanh nghiệp bỏ sót, dẫn đến tình trạng tờ khai bị treo và hàng hóa chậm thông quan. Để tránh những rắc rối pháp lý không đáng có, bài viết này WoExpress sẽ cập nhật chi tiết biểu phí mới nhất, đối tượng miễn giảm và quy trình nộp lệ phí chuẩn xác giúp doanh nghiệp vận hành lô hàng trơn tru nhất.
Lệ phí thủ tục hải quan là gì?
Trong lĩnh vực xuất nhập khẩu, lệ phí thủ tục hải quan là khoản tiền bắt buộc mà doanh nghiệp, tổ chức, cá nhân có hàng hóa xuất khẩu hoặc nhập khẩu phải nộp cho cơ quan Hải quan. Khoản phí này nhằm chi trả cho các hoạt động nghiệp vụ như kiểm tra chứng từ, giám sát hàng hóa và hoàn tất các hồ sơ pháp lý để lô hàng được phép thông quan hợp lệ.
Mọi quy định về mức thu, chế độ thu, nộp, quản lý và sử dụng lệ phí trong lĩnh vực hải quan hiện nay đang được áp dụng nghiêm ngặt theo Thông tư số 14/2021/TT-BTC do Bộ Tài chính ban hành. Đây là văn bản pháp lý cao nhất giúp doanh nghiệp tra cứu chính xác các mức phí và đối tượng được miễn giảm khi thực hiện thủ tục.
Phân biệt Lệ phí hải quan và Thuế xuất nhập khẩu
Nhiều doanh nghiệp mới thường nhầm lẫn giữa lệ phí và các loại thuế dẫn đến sai sót khi nộp tiền vào ngân sách nhà nước. Dưới đây là bảng so sánh giúp bạn phân biệt rõ hai khái niệm này:
| Tiêu chí | Lệ phí thủ tục hải quan | Thuế xuất nhập khẩu (VAT, TTĐB, BVMT…) |
| Bản chất | Khoản thu cố định cho việc thực hiện quản lý nhà nước về hải quan. | Nghĩa vụ tài chính biến đổi dựa trên trị giá và số lượng hàng hóa. |
| Cách tính | Tính theo số lượng tờ khai hoặc đơn (Ví dụ: 20.000 VNĐ/tờ khai). | Tính theo % thuế suất nhân với trị giá lô hàng hoặc mức thuế tuyệt đối trên đơn vị sản phẩm. |
| Mục đích | Phục vụ hoạt động kiểm tra, giám sát và vận hành hệ thống hải quan. | Điều tiết nền kinh tế, bảo hộ sản xuất trong nước và đóng góp ngân sách nhà nước. |
Biểu phí và lệ phí làm thủ tục hải quan chi tiết
Theo Điều 4 Thông tư 14/2021/TT-BTC, mức thu phí và lệ phí đối với hàng hóa, phương tiện vận tải được quy định rất cụ thể. Doanh nghiệp cần nắm rõ các con số này để lập dự toán chi phí chính xác cho mỗi lô hàng. Dưới đây là bảng tổng hợp mức thu mới nhất đang được áp dụng:
| STT | Nội dung thu phí và lệ phí | Mức thu (VNĐ) |
| 1 | Phí hải quan đối với hàng hóa XNK, phương tiện vận tải xuất/nhập cảnh | 20.000/tờ khai |
| 2 | Lệ phí đối với hàng hóa quá cảnh | 200.000/tờ khai |
| 3 | Phí hải quan kiểm tra, giám sát, tạm dừng làm thủ tục đối với hàng hóa có dấu hiệu xâm phạm quyền SHTT | 200.000/đơn |
| 4 | Phí hải quan cấp sổ ATA (Tạm nhập tái xuất hàng hóa) | 1.000.000/sổ |
| 5 | Phí hải quan cấp lại sổ ATA | 500.000/sổ |
| 6 | Lệ phí đối với phương tiện vận tải quá cảnh đường bộ (Ô tô, đầu kéo, máy kéo) | 200.000/phương tiện |
| 7 | Lệ phí đối với phương tiện vận tải quá cảnh đường thủy (Tàu, ca nô, xà lan, đầu kéo) | 500.000/phương tiện |
Các trường hợp được miễn nộp lệ phí hải quan
Căn cứ theo Điều 3 Thông tư 14/2021/TT-BTC, các trường hợp sau đây sẽ được miễn thu lệ phí thủ tục hải quan khi thực hiện hoạt động xuất nhập khẩu:
- Hàng nhân đạo & Ngoại giao: Viện trợ không hoàn lại, quà biếu từ thiện, đồ dùng của tổ chức quốc tế theo quy chế miễn trừ ngoại giao.
- Hàng hóa giá trị thấp: Gửi qua chuyển phát nhanh có trị giá từ 1.000.000 VNĐ trở xuống hoặc thuế dưới 100.000 VNĐ. Hàng thông thường có trị giá dưới 500.000 VNĐ hoặc thuế dưới 50.000 VNĐ.
- Giao thương biên giới: Hàng hóa trao đổi của cư dân biên giới trong định mức.
- Ưu đãi quốc tế: Hàng hóa quá cảnh được miễn phí theo các điều ước quốc tế mà Việt Nam là thành viên
Quy định về thời gian và phương thức nộp lệ phí hải quan
Căn cứ theo Thông tư 14/2021/TT-BTC, thời điểm nộp lệ phí được quy định linh hoạt để tạo điều kiện thuận lợi nhất cho luồng vận hành của doanh nghiệp như sau:
- Trường hợp nộp từng lần: Đây là hình thức phổ biến nhất. Người nộp phí phải hoàn thành nghĩa vụ thanh toán ngay khi đăng ký tờ khai hải quan. Hệ thống sẽ xác nhận đã nộp phí trước khi cho phép hàng hóa đi vào các bước thông quan tiếp theo.
- Trường hợp nộp theo tháng: Dành cho các doanh nghiệp có lượng tờ khai lớn và ổn định. Bạn có thể đăng ký với cơ quan hải quan để gom số lượng và nộp gộp. Thời hạn nộp chậm nhất là trong 10 ngày đầu của tháng kế tiếp
Để đẩy nhanh tốc độ thông quan, hầu hết doanh nghiệp hiện nay đều sử dụng hình thức nộp thuế điện tử và thông quan 24/7. Việc nộp qua cổng thanh toán điện tử giúp hệ thống hải quan gạch nợ tức thì, giúp tờ khai được thông quan ngay lập tức kể cả trong ngày nghỉ hay ngày lễ .
Quy trình nộp lệ phí thủ tục hải quan
Hiện nay, để tối ưu thời gian, đa số doanh nghiệp đều thực hiện nộp lệ phí thông qua cổng thanh toán điện tử. Dưới đây là quy trình này đảm bảo tính bảo mật và giúp hàng hóa được thông quan ngay lập tức mà bạn có thể tham khảo
Bước 1 – Khai báo tờ khai trên phần mềm ECUS/VNACCS
Doanh nghiệp tiến hành khai báo và truyền tờ khai hải quan chính thức. Sau khi nhận được số tờ khai và kết quả phân luồng, hệ thống sẽ tự động tính toán khoản lệ phí (thường là 20.000 VNĐ) dựa trên dữ liệu đã khai.
Bước 2 – Truy cập Cổng thanh toán điện tử (E-Payment)
Doanh nghiệp đăng nhập vào hệ thống Nộp thuế điện tử của Tổng cục Hải quan hoặc sử dụng dịch vụ nộp thuế/phí trên Internet Banking của các ngân hàng đã ký thỏa thuận phối hợp thu với Tổng cục Hải quan (như Vietcombank, Vietinbank, BIDV…).
Bước 3 – Lập lệnh nộp tiền và chọn mã tiểu mục
Đây là bước quan trọng nhất để tránh sai sót:
- Mã tiểu mục: Chọn đúng mã 2701 (Lệ phí hải quan).
- Thông tin nộp tiền: Điền đầy đủ số tờ khai, mã Chi cục Hải quan nơi mở tờ khai.
- Số tiền: Nhập chính xác số tiền lệ phí cần nộp (ví dụ: 20.000 VNĐ cho 1 tờ khai).
Bước 4 – Xác nhận nộp tiền và gạch nợ hệ thống
Sau khi xác nhận giao dịch bằng chữ ký số, ngân hàng sẽ gửi thông báo nộp tiền thành công (thông điệp 216) cho hệ thống Hải quan. Hệ thống sẽ tự động gạch nợ lệ phí cho tờ khai. Trạng thái nợ lệ phí của tờ khai sẽ chuyển sang “Đã nộp”. Lúc này, cán bộ hải quan mới có thể thực hiện thao tác thông quan chính thức trên hệ thống.
Những lưu ý thường gặp khi nộp lệ phí làm thủ tục hải quan
Việc nộp lệ phí tuy số tiền không lớn (chỉ từ 20.000 VNĐ) nhưng lại là điều kiện để gạch nợ hệ thống và thông quan hàng hóa. Để quá trình này diễn ra suôn sẻ, bạn cần lưu ý các điểm sau:
Kiểm tra trạng thái nợ lệ phí thường xuyên
Nhiều doanh nghiệp bị hệ thống từ chối đăng ký tờ khai mới do còn nợ lệ phí của các tờ khai cũ quá hạn. Hãy thường xuyên truy cập vào Cổng thông tin một cửa quốc gia để kiểm tra danh sách nợ lệ phí và hoàn thành kịp thời.
Cẩn trọng với Mã tiểu mục (2701)
Khi nộp tiền qua Internet Banking hoặc nộp thuế điện tử, hãy đảm bảo chọn đúng mã tiểu mục 2701. Nếu chọn sai sang các mã tiểu mục thuế khác, số tiền sẽ không được ghi nhận cho lệ phí hải quan, dẫn đến việc tờ khai vẫn ở trạng thái “Nợ lệ phí” dù tiền đã trừ khỏi tài khoản.
Thời hạn đối với doanh nghiệp nộp theo tháng
Nếu doanh nghiệp chọn hình thức nộp gộp theo tháng, phải đảm bảo nộp chậm nhất vào ngày 10 của tháng kế tiếp. Quá thời hạn này, hệ thống VNACCS/VCIS sẽ tự động khóa mã định danh (ID) của doanh nghiệp, khiến bạn không thể truyền bất cứ tờ khai nào cho đến khi nợ được thanh toán.
Đồng bộ thông tin nộp tiền
Khi nộp tiền, các thông tin về Mã số thuế doanh nghiệp, Số tờ khai và Mã Chi cục hải quan phải khớp tuyệt đối. Chỉ một sai sót nhỏ về con số cũng khiến lệnh chuyển tiền bị treo, buộc doanh nghiệp phải làm thủ tục điều chỉnh chứng từ nộp ngân sách rất mất thời gian.
Việc hoàn thành lệ phí thủ tục hải quan đúng thời hạn và chính xác mã tiểu mục là bước cực kỳ quan trọng để giải phóng hàng hóa. Hy vọng những hướng dẫn chi tiết về biểu phí và quy trình nộp điện tử trên đã giúp bạn tối ưu hóa công việc khai báo hằng ngày. Nếu bạn cần hỗ trợ về thủ tục hải quan trọn gói hoặc giải đáp thắc mắc về nợ lệ phí, hãy liên hệ ngay với WoExpress để được đội ngũ chuyên gia tư vấn chi tiết!
Xem thêm:
- Hướng dẫn tra cứu tờ khai hải quan chi tiết từ A-Z
- Thủ tục thông quan hàng hóa: Quy trình và Những điều cần biết
